Participanții consorțiului Genome 10K la conferința anuală, care are loc acum la New York, au anunțat lansarea proiectului internațional „Genomuri vertebrate”, sarcina sa este de a colecta genomul tuturor celor 66 de mii de specii de vertebrate care trăiesc astăzi pe planetă. Gizmodo spune mai multe despre obiectivele și obiectivele proiectului.
În 2009, biologii americani David Haussler, Oliver Ryder și Stephen O'Brien au fondat proiectul Genome 10K, al cărui obiectiv era secvențierea a 10.000 de genomi de vertebrate. Inițial, 55 de oameni de știință din grădini zoologice mari, centre de cercetare și muzee au participat la proiect. La început, nu a fost clar cât timp va dura asamblarea genomilor de o calitate suficientă. Dar cu costul și simplificarea metodelor de secvențiere, a devenit clar că proiectul își va finaliza sarcinile în câțiva ani. În ultimii trei ani, participanții la proiect au comparat principalele tehnologii pentru secvențierea ADN-ului și analiza rezultatelor obținute pentru a-l alege pe cel care va crea „genomuri de platină”.
Ieri, membrii genomului 10K au anunțat lansarea unui nou proiect de genome de vertebrate, care are ca scop colectarea genomului masculin și feminin a 66.000 de specii de vertebrate. Proiectul va implica 150 de oameni de știință care reprezintă 50 de organizații din 12 țări. Potrivit unuia dintre fondatorii proiectului, Oliver Ryder, drept urmare, biologii vor putea înțelege motivele dispariției speciilor, inclusiv dacă au existat încrucișări strâns legate în istoria speciei, „blocaje”, ca urmare a căreia diversitatea genetică a speciei a scăzut sau ștergerile - mutații care se pot „opri”. »Gene necesare supraviețuirii organismului.
Împreună cu anunțarea noului proiect, oamenii de știință au prezentat imediat primele rezultate ale activității sale: genomurile a 15 specii de vertebrate, inclusiv papagalul bufniță kakapo pe cale de dispariție, endemic în Noua Zeelandă și ornitorincul australian. Acestea și toate celelalte genomi pe care cercetătorii intenționează să le colecteze vor fi publicate în domeniul public, în baza de date genomică Noah's Ark.
Participanții intenționează să secvenționeze secțiuni scurte de ADN genomic și să colecteze din ele secvențe din ce în ce mai lungi până la întregul cromozom și apoi să le „lipească” folosind algoritmi special concepuți pentru proiect.
Anterior, cercetătorii au putut citi genomul unei persoane pe un secvențier de buzunar de dimensiuni smartphone. Dispozitivul a stabilit recordul pentru cea mai lungă citire a unei molecule de ADN, a fost capabil să secvențeze secvențe de până la 882 mii de perechi de baze.
Ekaterina Rusakova
